基于网络间随机游走算法预测IncRNA-疾病关联性

发布时间：2024-03-01 03:25

　　长链非编码RNA的表达情况和许多疾病病理过程的发生密切相关。它们可能是诊断、预后和治疗这些疾病的重要生物标志物。推断潜在的lncRNA-疾病关联性对于揭示疾病的发病机制、开发新的药物以及优化个性化治疗至关重要。然而,验证lncRNA-疾病相关性的生物学实验是非常耗时和昂贵的,开发有效的计算模型预测lncRNA-疾病关联性已成为计算生物学的重要研究课题。本文基于网络间随机游走算法,提出了一种新的基于网络的方法预测潜在的lncRNA-疾病关联。首先,计算疾病语义相似性、lncRNA功能相似性和基因功能相似性用于构造疾病相似性网络、lncRNA相似性网络和基因相似性网络。接着在3个网络中融入lncRNA-疾病、lncRNA-基因和基因-疾病关联信息。最后,在3个网络中进行若干个随机游走步骤,从而推断疾病与相应网络中lncRNA之间的关系。应用该模型到LncRNADisease2.0数据库中的lncRNA-疾病、lncRNA-基因以及CREEDS数据库中的基因-疾病的关联信息数据,利用10倍交叉验证法和受试者工作特征曲线下面积的大小评估该模型的预测效果。研究结果表明,与其他算法相比,该算法有更...

【文章页数】：50 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２．１胃癌的本体图??最新的ＤＯ版本包含９０６９个Ｄ０１Ｄ疾病术语，其中６２％的术语有文本定义

浙江理工大学硕士学位论文?基于网络间随机游走算法预测ＩｎｃＲＮＡ－疾病关联性??／??１２５３??＼?／??ＪＥＩＳｉ??＇?．?．?４??：?’圓圓細??／??”一?ｒ??＼??＼??图２．１胃癌的本体图??最新的ＤＯ版本包含９０６９个Ｄ０１Ｄ疾病术语，其中６２％的术语有文本定....

图４．１网络随机游走算法结构框架??

浙江理工大学硕士学位论文?基于网络间随机游走算法预测ＩｎｃＲＮＡ－疾病关联性??疾病语义相似性网络?ＩｎｃＲＮＡ功能相似性网络??圈！麵??職ｒ：???Ｉ??基Ｗｉ５义相似性Ｈ络??一?＿預》的ｌｎｄＭ－ｆｆｅ病关联??图４．１网络随机游走算法结构框架??４．２计算疾病语义相似性....

本文编号：3915363