基于生物信息学的前列腺癌与结直肠癌肿瘤标志物预测研究

发布时间：2024-04-15 05:51

　　根据2019年1月国家癌症中心发布的最新一期全国癌症统计数据,2015年我国恶性肿瘤发病人数约为392.9万人,死亡人数约为233.8万人。这意味着平均每天有超过1万人被确诊为癌症,每分钟有7.5个人被确诊为癌症。与历史数据相比,这一数据呈持续上升态势。与此同时,近10多年来,恶性肿瘤的发病率每年保持约3.9%的增幅,死亡率每年保持2.5%的增幅;其中,结直肠癌成为危害我国人口健康的恶性肿瘤之一,其余4种分别是:肺癌、肝癌、上消化系统肿瘤和女性乳腺癌。此外,在男性当中,前列腺癌的发病率近年来上升趋势明显,已位居男性发病中的第6位。基因芯片和高通量测序技术的广泛应用,产生了大量的基因表达谱数据和测序数据。与此同时,新一代人工智能技术的出现,能够为分析这些生物大数据提供算法与技术基础,从而预测肿瘤相关标志物和筛选药物靶点。对于这些分析结果,可以通过实验室或临床实验进行验证,而在大数据时代则可以通过多个公开的生物信息数据库进行验证。这种综合分析在揭示癌症的生物学过程研究中扮演了重要的角色。本研究将通过生物信息学方法与工具,通过挖掘GEO(Gene Expression Omnibus)和TC...

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图1.1基因表达谱数据分布图：(a)GSE26910；(b)GSE69223；(c)GSE55945；(d)

重庆医科大学博士研究生学位论文批次效应和其他不必要的影响因素。归一化之后的DNA甲基化表达谱数据和基因表达谱数据如图1.4所示。图1.1基因表达谱数据分布图：(a)GSE26910；(b)GSE69223；(c)GSE55945；(d)GSE46602；(e)GSE30174Fi....

图1.2甲基化数据分布图：(a)GSE52955；(b)GSE73549；(c)GSE84749；(d)GSE76938Fig.1.2Datadistributionofmethylationprofilingdata:(a)GSE52955;(b)GSE73549;(c)

重庆医科大学博士研究生学位论文图1.2甲基化数据分布图：(a)GSE52955；(b)GSE73549；(c)GSE84749；(d)GSE76938Fig.1.2Datadistributionofmethylationprofilingdata:(a)GSE52955;(b)....

图1.3去除基因表达谱的批次效应Fig.1.3Rejectbatcheffectsforgeneexpressionprofilingdata

重庆医科大学博士研究生学位论文图1.3去除基因表达谱的批次效应Fig.1.3Rejectbatcheffectsforgeneexpressionprofilingdata18

图1.4归一化之后的基因甲基化表达谱：(a1)GSE76938genemethylationprofilingdatavaluedistribution；(a2)normalizationofGSE76938genemethylationprofilingdata；(b1)GSE73549genemethylationprofilingdatavaluedistribution；(b2)normalizationofGSE73549gene

重庆医科大学博士研究生学位论文图1.4归一化之后的基因甲基化表达谱：(a1)GSE76938genemethylationprofilingdatavaluedistribution；(a2)normalizationofGSE76938genemethylationprofil....

本文编号：3955832