急性肾损伤转录组学特征分析及潜在生物标记物的研究

发布时间：2024-04-06 16:55

　　急性肾损伤(Acute kidney injury,AKI)是临床中常见的急重症之一,据估计,我国2013年约有290万成年住院患者罹患AKI,其中约70万患者死亡。血肌酐和尿量是诊断AKI的重要指标,但上述指标受诸多因素的影响。近年,随着人类基因组学及生物样本大数据库的构建发展,对AKI相关数据的合理利用,能够帮助我们发现新型标记物,挖掘出基因层面潜在的病理生理学机制。目的:1.基于生物信息学理论挖掘AKI转录组芯片数据的信息特征;2.寻找能够早期预测AKI的新型准确的生物标记物;3.探讨该标记物相关的病理生理机制。方法:1.检索在欧洲生物信息学研究所(European bioinformatics institute,EBI)和美国国家生物技术信息中心数据库(National Center for Biotechnology Information,NCBI)中AKI相关的转录组芯片数据集;2.利用网页工具、R软件等对数据集的每一项研究中的实验组和对照组数据进行差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)计算分析;3.利用“clusterP...

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图2-3JUNB在不同实验组中的表达情况

b,c中，蓝色、红色点分别代表有显著性低表达、高表达的DEGs，黑色代表无明显意义的差异基因。热图为4个数据集所共同的DEGs。图2-3JUNB在不同实验组中的表达情况

本文编号：3946907