长链非编码RNA Silnr1调控干细胞多能性及重编程的作用和机制研究

发布时间：2024-04-07 05:53

　　研究背景:i PSCs的发现使得再生医学研究取得革命性的进展。然而i PSCs的诱导过程存在效率低、耗时长的缺点,限制了其广泛的临床应用。作为cohesin复合物的重要组成部分,Smc1对维持基因组三维空间结构具有重要作用。Smc1介导的多能性基因增强子与启动子之间染色质内环的形成可激活内源性干性基因的表达,是重编程过程中的必要步骤。为进一步探索多能性相关的染色质空间结构的调节因素,本研究在i PSCs内进行Smc1 RIP-seq,结合实验室前期i PSCs及成纤维细胞(fibroblasts,Fibs)转录组测序的RNA-seq数据,筛选出与Smc1结合且在i PSCs中高表达的lnc RNA Silnr1进行研究。后续实验将探讨Silnr1对干细胞多能性调控及重编程进程的影响及其作用机制。研究目的:1.明确在不同多能性状态下Silnr1的表达特点及其与多能性的相关性。2.探讨Silnr1在调控干细胞多能性及重编程过程中的作用。3.探究Silnr1在基因组内具有相互作用的基因,明确其调控干细胞多能性及重编程的靶基因。4.探讨Silnr1调控干细胞多能性及重编程进程的表观遗传学机制。...

【文章页数】：103 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图1.1基因组的三维空间结构层次[37]

6随着研究手段的不断深入，人类对于基因组的空间结构有了更加深入的认识。通过Hi-C技术发现转录活性相似的区域在空间上更相近。根据转录活性可分为“compartmentA”(转录激活区)和“compartmentB”（转录失活区）。转录激活区具有更高的基因密度、染色质可及性及激活的....

图1.2Cohesin复合体的结构[51]

8基因沉默，提示cohesin复合物介导的染色质内环形成是内源性lncRNAROR激活的表观遗传学因素[63]。Zhang等研究证实敲除Smc1后，Oct4,Sox2,Nanog基因启动子与增强子之间的染色质内环消失，抑制重编程[59,64]。相较于分化细胞，干细胞具有其特定的空....

图1.3lncRNA作用机制的示意图

9调节等来调控细胞的生长、分化、代谢以及凋亡等[68-70]。lncRNA的功能、作用机制与其在细胞内的位置具有一定相关性。我们将根据其在细胞内位置分类论述lncRNA的主要作用机制（图1.3）。细胞核内lncRNAs：①作为向导招募染色质重塑因子至特定的位点[71]。②作为“支....

图1.4在重编程过程中染色质内环形成是必要步骤[65]

121.5本研究立题依据iPSCs的发现极大的促进了再生医学的发展。虽经历了十余年的快速发展，但目前iPSCs的临床应用仍存在瓶颈，目前的诱导技术效率低、周期长，如何短时间内由诱导出大量用于临床治疗iPSCs仍是目前亟待解决问题。表观遗传学在重编程过程中发挥了重要的作用，主要涉及....

本文编号：3947776