海洋假交替单胞菌属细菌降解几丁质的特性及新型几丁质酶的表征
发布时间：2021-10-19 00:16
海洋是地球上最大的生态系统,海洋微生物在海洋生态系统和地球生物化学循环中起着极其重要的作用。几丁质是海洋中含量最丰富的有机碳,海洋微生物对几丁质的降解代谢,是海洋物质循环的重要推动力。海洋中能够降解几丁质的微生物有很多,但绝大多数海洋微生物降解几丁质的机制仍不清楚。假交替单胞菌属是海洋特有细菌,其广泛分布于全球海洋中,并具有相对较高的丰度。最近,基于生物信息学分析,有研究表明较高比例的假交替单胞菌中含有几丁质降解基因簇（CDC）,预示着假交替单胞菌属可能是海洋中重要的几丁质降解细菌类群。但是,到目前为止,关于假交替单胞菌的几丁质降解能力的研究还较少,缺少在属水平开展假交替单胞菌降解几丁质的系统研究,假交替单胞菌在海洋几丁质降解中的贡献还不清楚。假交替单胞菌降解几丁质的机制也不清楚。几丁质酶等糖苷水解酶在海洋几丁质的微生物降解中发挥重要作用,其能将几丁质水解成几丁寡糖或单糖。GH18家族几丁质酶因其分布广泛及对结晶几丁质的高效降解,一直以来是该领域的研究热点。GH18家族中,相比于对外切几丁质酶的广泛研究,对内切几丁质酶的研究还较少,GH18家族内切几丁质酶的催化机制到目前为止还不清楚。...
【文章来源】：山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：148 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－４假交替单胞菌属产色素菌株和不产色素菌株的糖苷水解酶多维酶谱??分析（Ｐａｕｌｓｅｎ?ｅｔ?ａｌ．?２０１９）??
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【参考文献】：
博士论文
[1]海洋细菌属假交替单胞菌属全基因组测序及比较基因组学研究[D]. 荣金诚.山东大学 2016
[2]海洋细菌DL-6几丁质酶和几丁质结合蛋白的生化性质与功能研究[D]. 王晓辉.大连理工大学 2016
硕士论文
[1]基于基因组学的假交替单胞菌属不同种的多糖降解和代谢途径的比较研究[D]. 刘敏.山东大学 2017
本文编号：3443783
【文章来源】：山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：148 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－４假交替单胞菌属产色素菌株和不产色素菌株的糖苷水解酶多维酶谱??分析（Ｐａｕｌｓｅｎ?ｅｔ?ａｌ．?２０１９）??
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都含有ＧＨ１８家族经典的印／ａ）８?ＴＩＭ－桶折叠结构的催化结构域ｃａｔａｌｙｔｉｃ??ｄｏｍａｉｎｓ，?ＣａＤ），即含有８个ｐ－ｓｈｅｅｔｓ和８个ａ－ｈｅｌｉｃｓ折叠回旋组成桶状结构??（Ｐｅｒｒａｋｉｓｅｔａｌ．?１９９４；Ｍａｔｓｕｍｏｔｏｅｔａｌ．?１９９９）。目前，已报道的细菌来源的几丁质酶??大多属于ＧＨ１８家族Ａ亚家族，而对Ｂ和Ｃ亚家族的研宄较少。??１ＣＴＮ?（Ｓｕｂｆａｍｉｌｙ?Ａ）?４Ｉ１ＭＣ?（Ｓｕｂｆａｍｉｌｙ?Ｂ）?２ＤＳＫ?（Ｓｕｂｆａｍｉｌｙ?Ｃ）??图１－７ＧＨ１８家族Ａ、Ｂ和Ｃ亚家族几丁质酶的结构??Ｆｉｇｕｒｅ?１－７?Ｔｈｅ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ?ｏｆ?ＧＨ１８?ｓｕｂｆａｍｉｌｉｅｓ?Ａ，?Ｂ?ａｎｄ?Ｃ．?（Ａ）?Ｔｈｅ?ｏｖｅｒａｌｌ??ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ｓｕｂｆａｍｉｌｙ?Ａ?ｃｈｉｔｉｎａｓｅ?ＣｈｉＡ?（ＰＤＢ?ｃｏｄｅ?ＩＣＴＮ）?（Ｈｏｒｎ?ｅｔ?ａｌ．?２００６）?ｆｒｏｍ??Ｓｅｒｒａｔｉａ?ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ．?（Ｂ）?Ｔｈｅ?ｏｖｅｒａｌｌ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ｓｕｂｆａｍｉｌｙ?Ｂ?ｃｈｉｔｉｎａｓｅ?Ａ／ｍＣｈｉ６０??（ＰＤＢ?ｃｏｄｅ?４ＨＭＣ）?（Ｍａｌｅｃｋｉ?ｅｔ?ａｌ．?２０１３）?ｆｒｏｍ?Ｍｏｒｉｔｅｌｌａ?ｍａｒｉｎａ．?（Ｃ）?Ｔｈｅ?ｏｖｅｒａｌｌ??ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｃａｔａｌｙｔｉｃ?ｄｏｍａｉｎ?（ＡＤ２ｐＦ＿ｃｈｉＡ，ＰＤＢ?ｃｏｄｅ?２ＤＳＫ）?ｏｆ?ｓｕｂｆａｍｉｌｙ?Ｃ??ｃｈｉｔｉｎａｓｅ?ＰＦ－ＣｈｉＡ?（Ｎａｋａｍｕｒａ?ｅｔ?ａｌ．?２００７）?ｆｒｏｍ?Ｐｙｒｏｃｏｃｃｕｓ?ｆｕｒｉｏｓｕ
【参考文献】：
博士论文
[1]海洋细菌属假交替单胞菌属全基因组测序及比较基因组学研究[D]. 荣金诚.山东大学 2016
[2]海洋细菌DL-6几丁质酶和几丁质结合蛋白的生化性质与功能研究[D]. 王晓辉.大连理工大学 2016
硕士论文
[1]基于基因组学的假交替单胞菌属不同种的多糖降解和代谢途径的比较研究[D]. 刘敏.山东大学 2017
本文编号：3443783
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