几类非血红素氧化酶催化机理的理论研究

发布时间：2022-07-20 16:08

　　酶参与催化生命体内的各种代谢反应。相比于传统催化剂,酶的显著优点包括高效性、催化反应专一性以及反应条件温和等。随着酶学的不断发展,酶已经被广泛应用于医药、食品、轻工、环保以及相关科研领域。近年来,随着化学手段、结构生物学、生物信息学和基因操作等技术的发展,科研工作者可以对酶分子进行修饰、改造、设计和开发,使其满足医药和工农业的需求。因此,深入研究酶的结构、性质、功能和催化机理不仅有助于阐明生命现象的本质、理解酶的生物学功能,对于拓展酶的应用和发展酶工程也具有十分重要的意义。在酶学研究中,使用实验方法可以得到酶促反应的反应速率、酶蛋白的晶体结构数据、动力学参数、突变结果等数据。而理论计算则能够给出实验上难以捕获的过渡态和中间体结构,以及反应过程中所涉及的能量学信息等,对实验结果进行补充和解释。随着计算机技术和算法开发的不断发展,计算化学在大尺度生物化学体系的研究中已经成为一个重要的工具。本论文使用分子对接方法、分子动力学模拟以及量子力学与分子力学结合（QM/MM）方法对几类非血红素氧化酶体系进行了系统的理论研究。本文所涉及到的氧化酶均含有金属辅酶因子。由于金属酶分布广泛,并且金属离子的电... 

【文章页数】：195 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

图１－１酶促反应（实线）和非酶反应（虚线）所对应的活化能??

图２－１底物分子对接进入诺加霉素合成酶ＳｎｏＫ的活性位点中（ＰＤＢ编号５ＥＰＡ）??

图２－２?ＱＭ／ＭＭ计算中的ＱＭ区和ＭＭ区??


本文编号：3664306