实验红鲫标准化关键技术研究和转录组分析

发布时间：2024-04-18 06:18

　　目的:1.根据实验红鲫标准化的要求,进一步筛选和建立实验红鲫C1HD系微卫星DNA分子标记,并以此微卫星标记做种群遗传纯合度分析。2.根据实验红鲫标准化的要求,建立实验红鲫水族箱标准化饲养和繁殖的方法,并优化用于实验红鲫近交系保种的雌核发育繁殖方法。3.为推广实验红鲫应用,探索实验红鲫用于核辐射生物效应研究,筛选实验红鲫对核辐射敏感的miRNA生物标志物。方法:1.利用红鲫全基因组序列信息,采用生物信息学分析技术提取实验红鲫1-6个碱基重复序列的微卫星DNA序列,使用primer 5设计引物进行PCR扩增,以8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳区分PCR扩增产物的目的片段,对其中特异性条带进行测序及验证,并与其近缘物种(金鱼、青鲫、杂交红鲫及鲤鱼等)进行比较,筛选出实验红鲫C1HD系特异性的微卫星分子标记,并以此微卫星标记对实验红鲫C1HD系进行雌核发育试验种群的遗传纯合度分析。2.通过室内水族箱与室外小鱼池及水族箱不同水质环境条件的比较研究,分析光照、仿生态造景、水流等综合环境因素对实验红鲫生长发育和繁殖的影响,综合比较实验红鲫不同实验组合的养殖效果。设置5个室内实验组合及1个室外实验组,分...

【文章页数】：85 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2.14号微卫星位点Figure2.1ElectrophoresisofSSR-4

12图2.14号微卫星位点Figure2.1ElectrophoresisofSSR-4注：图a的泳道1-10号为实验红鲫，11号为marker，12-18号为琉金，19-23号为杂交红鲫；图b的泳道1-8号为实验红鲫，9号为marker，10-15号为洞庭湖鲫，16-21号为锦....

图2.286号微卫星位点Figure2.2ElectrophoresisofSSR-86

12图2.14号微卫星位点Figure2.1ElectrophoresisofSSR-4注：图a的泳道1-10号为实验红鲫，11号为marker，12-18号为琉金，19-23号为杂交红鲫；图b的泳道1-8号为实验红鲫，9号为marker，10-15号为洞庭湖鲫，16-21号为锦....

图2.3434号微卫星位点Figure2.3ElectrophoresisofSSR-434

13鲤。Note:Inpicturea,Thelanes1-10arelaboratoryredcruciancarp,the11thisDNAmarker,the12-18aregoldfish,andthe19-24arehybridredcruciancarp;Inpict....

图2.4基于UPGMA的Nei’s无偏差遗传距离聚类树

16表2.8Nei’s无偏差遗传相似度与遗传距离Table2.8Nei"sunbiasedgeneticsimilarityandgeneticdistance实验鱼实验红鲫琉金杂交红鲫洞庭湖鲫锦鲤实验红鲫0.50820.61620.47980.1181琉金0.67690.775....

本文编号：3957542