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里氏拟石磺与平疣桑椹石磺群体遗传多样性及遗传结构分析

发布时间:2024-04-23 22:53
  石磺科(Onchidiidae)属软体动物门(Mollusca),腹足纲(Gastropoda),有肺亚纲(Pulmonata),缩眼目(Systellommatophora),为栖息于滩涂及红树林地区的一群潮间带和潮上带贝类,广泛分布于除极地外的世界各地,包含100多个物种。本论文采用线粒体16S rDNA和细胞色素c氧化酶亚基I(Cytochromeoxidase subunit I,CO I)基因分析了里氏拟石磺和平疣桑椹石磺的群体遗传多样性及遗传结构,并对其群体分化,遗传结构的产生原因进行了推断。 本论文的实验结果如下: 1、采集中国沿海及泰国普吉岛里氏拟石磺共187个个体,其中广东湛江(ZJ)=30、广西东兴(DX)=28、北海(BH)=30、浙江苍南(CN)=31、福建宁德(ND)=10和海南东寨港(HN)=18、海南文昌(WC)=23、泰国普吉岛(TH)=17。对其16S rDNA比对剪接获得一个372bp的同源序列,包括变异位点56个,其中单变异位点40个,简约信息位点16个。群体平均的T、C、A、G碱基含量分别为30.7%、16.2%、30.0%和23.1%,A+T含...

【文章页数】:76 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

图2-1部分里氏拟石磺群体16SrDNA序列扩增电泳图

图2-1部分里氏拟石磺群体16SrDNA序列扩增电泳图

13图2-1部分里氏拟石磺群体16SrDNA序列扩增电泳图Fig.2-1Amplifiedproductsofmitochondrial16SrDNAofParaoncidiumreev


图2-2两组里氏拟石磺群体的IBD分析

图2-2两组里氏拟石磺群体的IBD分析

2-2两组里氏拟石磺群体的IBD分析。(左)中国沿海群体(除去TH);(右)所DplotsfortwogroupingsofParaoncidiumreevesiipopulations.(Left)Chinesepopula(Right)The....


图2-3里氏拟石磺16SrDNA序列的单倍型网络图

图2-3里氏拟石磺16SrDNA序列的单倍型网络图

17图2-3里氏拟石磺16SrDNA序列的单倍型网络图etworkofallmtDNA16SrDNAsequenceshaplotypesofParaoncidiumreevesiip


图3-1里氏拟石磺的COI基因部分片段序列扩增产物电泳图

图3-1里氏拟石磺的COI基因部分片段序列扩增产物电泳图

利用软件Arlequin3.5中的分子方差分析内的遗传分化及Fst值。SAMOVA1.0[59]软件对群体遗分析方法同第二章1.3。OI基因部分序列扩增结果COI1490和HCOI2198扩增基因组DNA,PCR产物显示,在约700bp位置处....



本文编号:3962871

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