南方拟微卫星标记筛选及遗传多样性分析

发布时间：2024-04-16 02:44

　　南方拟■是一种分布于长江以南各水系的小型经济鱼类,目前仅有野生资源。为查明珠江流域其群体遗传结构现状,试验采用RAD-Seq技术筛选出36个多态性微卫星标记,其中29个为高度多态性(多态信息含量>0.50)位点,6个为中度多态性(0.25<多态信息含量<0.50)位点和1个为低度多态性(多态信息含量<0.25)位点。选取6个高度多态性位点研究珠江流域的北江、桂江、都柳江、融江、左江、右江、黔江及郁江8个江段南方拟■群体的遗传多样性和种群分化情况,结果显示,共检测到98.17个等位基因,平均等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、香农指数和多态信息含量值分别12.2713、6.0575、0.5389、0.7679、1.8974和0.7379,表明珠江流域南方拟■的遗传多样性丰富。6个微卫星位点在8个群体中检测结果显示,平均群体间分化系数为0.1028,表明10.28%的遗传变异来自于群体间,89.72%的遗传变异来自于群体内,属于中等分化水平;平均群体内近交系数为0.2987,表明群体内杂合子缺失严重;基因流为1.0075～4.7308,说明群体间的基...

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图1珠江流域8个南方拟群体采样位点

表1试验样品采集信息Tab.1Informationonsamplesintheexperiment采集江段River样本数量Sample编号Number北江BJ40BJ01-40桂江GJ39GJ01-39都柳江DLJ40DLJ01-4....

图2位点NC78毛细血管电泳分型结果

36个微卫星分子标记在南方拟群体中共检测到2701个扩增片段,获得的微卫星扩增片段长度为136～363bp,平均为222bp。扩增片段主要集中在200～300bp,占比67.57%,其次是在100～200bp,占比29.43%,扩增片段大小集中在300bp以内的占97%....

图3微卫星片段的频率分布

微卫星位点的遗传多样性参数分析结果显示,等位基因数为3～31,总计374,平均等位基因数为10.4,NC71和NC76等位基因数最少,仅有3个等位基因,等位基因数最多的是NC74,为31,其次是NC57,等位基因数为23;有效等位基因数最小的是NC76,其有效等位基因数为1.2....

本文编号：3956324