辽宁省不同地区春季刺参肠道菌群分析与比较

发布时间：2020-03-30 16:06

【摘要】：细菌间协同相互作用和菌群组成对生态系统功能有决定作用。肠道菌群被认为具有维持肠道微生态的功能,包括刺激免疫、竞争营养、竞争病原菌结合位点、产生抗菌物质以及促进有益物种生长等来维持肠道微生态稳定。刺参(Apostichopus japonicus)是一种常见的海水经济物种,并同时具有一定的科学研究价值。但关于刺参肠道定殖菌群的研究较为少见。本课题选取15头来自不同地点、不同生长模式的健康刺参(每处3头),取出肠道内容物后,进行了16S rDNA高通量测序分析,所选用的刺参分别来自于黄海海域的獐子岛(ZZD)、丹东(DD)和庄河(ZH),来自于渤海海域的葫芦岛(HLD)和来自于黄渤海交界处的旅顺(LS),其中,獐子岛和旅顺附近海域刺参生长模式为野生,其余三组为养殖。经测序分析,共获得952 005条有效数据,并聚类成27 117个可操作分类单元(OTUs);经物种注释得到,五组中丰度最高的门均是变形菌门(Proteobacteria),但在属水平上有差异:样品组DD、ZZD、ZH和HLD组中优势菌为变形菌门盐单胞菌属(Halomonas),具体含量为DD,36.97%,ZZD,42.66%,ZH,31.73%,HLD,31.96%,其次为希瓦氏菌属(Shewanella),具体含量为DD,9.13%,ZZD,14.34%,ZH,9.56%,HLD,8.95%;而LS组为拟杆菌门(Bacteroidetes)拟杆菌属(Bacteroides),含量为3.72%;根据Alpha多样性结果,样品组LS观察到的物种数最多,菌群多样性最高;样品组ZZD菌群多样性最低;样品组DD菌群丰富度最低;根据Beta多样性分析,样品组LS与其他四组之间有很大差别,样品组ZZD与HLD之间较为相似。通过比较不同地理环境来源的刺参肠道菌群,发现黄渤海交界处组(LS)的刺参肠道样品中变形菌门、盐单胞菌属和希瓦氏菌属含量显著低于另外两组(黄海组包括ZZD、DD和ZH,渤海组包括HLD)(P0.05),而酸杆菌门、拟杆菌门、芽单胞菌、疣微菌门、浮霉菌门和拟杆菌属含量显著高于其他组(P0.05);黄渤海交界处组刺参肠道菌群的shannon指数、chao1指数和ACE指数均显著高于其他两组(P0.05)。以上结果说明地理环境影响刺参肠道菌群。乳酸菌(lactic acid bacteria,LAB)和双歧杆菌(Bifidobacterium)在所有组中均有发现,总含量为0.58%到4.66%,乳酸菌平均含量为1.01%,双歧杆菌平均含量为0.99%,可作为潜在益生菌进行开发。通过比较野生和养殖刺参肠道菌群,发现野生组刺参肠道菌群中,酸杆菌门、放线菌门、芽单胞菌门、疣微菌门和浮霉菌门的含量显著高于养殖组。证明生长方式能够影响刺参肠道菌群。本课题中发现刺参肠道固有菌、优势菌可以作为潜在益生菌进行后续开发,而生长方式和生长环境对刺参肠道菌群影响的比较,可以为刺参用微生物制剂的开发提供参考,为刺参差异化养殖提供技术支持。
【图文】：

注：样品名与对应样品来源见表 2-1Notes: group names and their represented habitats are in Tab. 2-1图 2-2 以抽取的测序数据量与对应的物种数（OTUs 数目）构建的物种多样性稀释曲线Fig.2-2 Rarefaction curves of observed species of A. japonicus at 97% similarity bason OTUs

注：样品名与对应样品来源见表 2-1Notes: group names and their represented habitats are in Tab. 2-1图 2-3 以样品中的OTUs按相对丰度由大到小排序的编号与OTUs中的相对丰度获得的点连接绘制的等级丰度曲线Fig. 2-3 Rank Abundance curves of observed species of A. japonicus at 97% similaritybased on OTUs2.2.3 物种分布2.2.3.1 物种相对丰度在所有的刺参肠道样品中，，共鉴定到 45 门、105 纲、207 目、385 科和 811 属。超过 89.3%的 Tags 能够被鉴定到门水平，DD、ZZD、LS、ZH 和 HLD 分别鉴定到 26.3±6.6、26.6±3.2、34.0±1.0、32.3±4.0 和 29.0±2.6 个门类。在门水平上，丰度 Top10 的门类在样品组 DD、ZZD、ZH 和 HLD 中是一致的，样品组 LS 与其它四组不同。是样品组 DD、ZZD、ZH 和 HLD 的丰度 Top10 的门类依次为变形菌门
【学位授予单位】：大连海洋大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：S917.4

【参考文献】

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5 李建光;徐永平;李晓宇;王丽丽;包鹏云;蒲红宇;车鉴;王熙涛;;不同养殖季节仿刺参肠道与养殖环境中菌群结构的特点[J];水产科学;2014年09期

6 黄卫强;张和平;;分子生物学技术在肠道菌群研究中的进展[J];微生物学通报;2014年06期

7 宫魁;王宝杰;刘梅;蒋克勇;邱楚雯;骆作勇;范瑞用;王雷;;乳酸菌及其代谢产物对刺参幼体肠道菌群和非特异性免疫的影响[J];海洋科学;2013年07期

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3 黄华伟;养殖刺参（Apostichopus japonicus）腐皮综合症的发生与异养菌区系间的关系[D];中国海洋大学;2007年

本文编号：2607757