基于变换式组合推荐算法的非编码RNA关联系统的研究与实现

发布时间：2024-03-07 17:52

　　近年来,人工智能普及和发展的速度就像飞驰的列车,越来越多研究生物大分子关系的科研人员也乘上了这趟列车。因为相对传统生物医学实验而言,这可以极大地节省研究成本和精力。最近发现,非编码RNA在发育、代谢、疾病等生命活动中发挥着至关重要的作用。非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA,长度各不相同,从几十个到几百个核苷酸不等。长非编码RNA与微小RNA都属于非编码RNA,并且长非编码RNA可以调控微小RNA,从而能够对疾病产生一定的影响。因此,运用推荐算法研究长非编码RNA与微小RNA的关联技术成为了当前的研究热点。在本实验中,采用了变换式组合推荐算法。该算法首先使用高斯算法和翁施算法计算非编码RNA相似性,并且通过变换系数α把K近邻矩阵分解,置信度算法和余弦相似度算法组合,根据变换系数α的变化而采用不同的算法。然后,将组合推荐算法应用在了生物信息学领域,推荐TOP长非编码RNA与微小RNA关联。在五折交叉验证实验中,三个模型在所属变换系数区间内分别取得了0.8217,0.8810和0.9814的AUC值。进一步地又分别基于不同非编码RNA类型测试集去测试变换式组合推荐算法的适用性,并且对三个实...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1-1长非编码RNA和微小RNA关系网络模型

第1章绪论3之间已知关系的二部图组成。此外，他们还假设彼此高度相似的微小RNA与长非编码RNA具有相似的相互作用或非相互作用模式。随后，Liu等人提出了LMFNRLMI模型，该模型利用邻域内最强的相邻关系，通过K近邻思想建立邻接矩阵，推荐长非编码RNA和微小RNA之间地相关性[2....

图3-1系统总体功能用例图

第3章系统需求分析和系统设计11图3-1系统总体功能用例图3.1.1.1注册登录功能需求分析在用户接触到的系统当中，基本都包含注册登录功能，这是为了更好地保护系统以及使用此系统的人，并且可以记录使用者操作信息，从而为使用者提供所需便利。因此，在数据库中会相应的添加使用者信息表。此....

图3-2注册登录功能用例图

第3章系统需求分析和系统设计11图3-1系统总体功能用例图3.1.1.1注册登录功能需求分析在用户接触到的系统当中，基本都包含注册登录功能，这是为了更好地保护系统以及使用此系统的人，并且可以记录使用者操作信息，从而为使用者提供所需便利。因此，在数据库中会相应的添加使用者信息表。此....

图3-3数据准备功能用例图

第3章系统需求分析和系统设计123.1.1.2数据准备功能需求分析非编码RNA数据一般是以字符序列的形式存储的，而本系统建模计算时通常使用数字或字符来计算，所以为了满足这个需求，便有了数据准备功能。在这个过程中，需要将使用者输入的非编码RNA序列转化为本系统所需要的格式，并且将无....

本文编号：3921519