基于基因标志物构建的癌症患者预后指数优化研究

发布时间：2024-02-23 13:35

　　癌症是人类面临的复杂疾病之一。目前治疗方法主要是传统的手术治疗,其次是局部放疗、化学疗法和内分泌治疗,但是术后复发和转移仍是困扰研究者的主要问题。随着生物信息学的发展,基因治疗逐渐应用于癌症。基因治疗的预后效果依赖于癌症基因标志物的准确度,因此筛选癌症基因标志物成为当前的研究热点之一。为了筛选具有较高诊断与鉴别能力的癌症基因标志物,本文主要探讨基于基因标志物构建的癌症患者预后指数优化方法。首先,对来源于肿瘤基因组图谱数据库的癌症基因表达数据进行预处理,对癌症基因表达数据进行差异分析,选出癌症中差异表达的基因,分别对比当预后指数选取中位数、平均数和众数时的生存分析结果。然后,运用拟合函数法优化患者预后指数的选取,将差异表达的基因数据分组,进行生存分析和受试者特性曲线评估,筛选出差异性较大的基因,作为基因标志物。进而,运用基因综合表达数据库中的独立数据库,对筛选出的基因标志物进行评估,验证所筛选出基因标志物的预后结果。此外,本文以发病率较高的乳腺癌和死亡率较高的肺癌为例,运用优化的预后指数选取方法筛选出乳腺癌和肺癌的基因标志物,为乳腺癌和肺癌的治疗策略和准确预后提供一定的科学依据。

【文章页数】：45 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图3-1PI选取为中位数时的生存分析

第三章乳腺癌患者预后指数优化13第三章乳腺癌患者预后指数优化第二章主要研究了在选取癌症基因标志物时癌症患者预后指数优化方法。本章将讨论在选取乳腺癌的基因标志物时乳腺癌患者的PI优化问题。首先，对来源于TCGA数据库的乳腺癌数据进行预处理，选取差异表达基因的中位数、平均数和众数进行....

图3-2PI选取为平均数时的生存分析

西北民族大学硕士学位论文14（2）选取PI为差异表达基因的平均数时，平均数是差异表达基因组中所有数值的平均值，得到PI为0.428。获得PI选取为平均数时的生存分析如图3-2所示，p值为0.000032。从以上当PI分别选取中位数和平均数时的生存分析结果可以看出，乳腺癌患者PI选....

图3-3PI选取为众数时的生存分析

西北民族大学硕士学位论文14（2）选取PI为差异表达基因的平均数时，平均数是差异表达基因组中所有数值的平均值，得到PI为0.428。获得PI选取为平均数时的生存分析如图3-2所示，p值为0.000032。从以上当PI分别选取中位数和平均数时的生存分析结果可以看出，乳腺癌患者PI选....

图3-4当乳腺癌患者PI选取中位数时的ROC曲线和AUC值

第三章乳腺癌患者预后指数优化15ROC曲线及其对应的AUC值分别如图3-4、图3-5、图3-6所示。图3-4当乳腺癌患者PI选取中位数时的ROC曲线和AUC值图3-5当乳腺癌患者PI选取平均数时的ROC曲线和AUC值图3-6当乳腺癌患者PI选取众数时的ROC曲线和AUC值乳腺癌患....

本文编号：3907570