小麦不同器官/发育时期miRNA和tasiRNA的鉴定及其时空表达特征分析

发布时间：2024-02-20 05:02

　　小麦是重要的粮食作物之一，小麦的生产及小麦的产量和品质关系到世界粮食安全问题。小麦种子的形成和发育直接影响着小麦产量和品质。microRNA(miRNA)是近年来发现的真核生物体内普遍存在的一类具有重要调控功能的非编码小分子RNA(sRNA)，其大小在20-25nt之间。大量研究发现miRNA参与基因转录后调控；在植物的生长、发育和逆境胁迫应答等各种生物学过程中发挥重要的调节作用。迄今，植物miRNA的研究已经取得了很大进展； miRBase数据库(Release21, June2014;http://www.mirbase.org)中登录注册的植物成熟miRNA已有10892条；其中的绝大多数miRNA都是来自于全基因组序列已知的水稻(713条)、杨树(401条)、拟南芥(427条)、二穗短柄草(525条)、玉米(321条)等物种。关于miRNA在植物种子发育中的调控作用已在水稻、拟南芥、玉米、大麦等物种展开研究。相比之下，小麦染色体组复杂，基因组庞大，全基因组序列组装尚待完成；小麦中鉴定出的miRNA数量非常有限，在miRBase中登录注册的小麦miRNA仅有119条。因此，小麦m...

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【部分图文】：

图1-1植物中miRNA的合成途径（OlivierVoinnet,2009）

大部分的植物miRNA在基因组上具有一个独立的转录单元，在转录的过程中由一个转录单元可加工成多条miRNA。miRNA在植物体内的生成是一个复杂的过程，有多种酶和功能蛋白参与。具体步骤见图1-1。首先miRNA基因在RNA聚合酶（PolII）的作用下转录成一个或者多个较长的初级转....

图1-2颈环引物RT-PCR的原理图（Mucksteinetal.2006）

并且比较了不同处理模关性。目前这种TaqMan标记的颈环在利用颈环特异引物对番茄中的7体系对其进行定量检测。结果显示用NA表达差异的检测，并且这种方法。T-PCR绍了对miRNA的3′端加多个A后AP）处理总RNA（图1-3），使miR含有接头序列的....

图1-3polyAqRT-PCR的原理图（ShiandChiang.2005）

选取了5条小麦miRNA，包括miR159、miR166颈环引物RT-PCR和miRNA加尾RT-PCR两种试的5个发育时期（幼苗、旗叶，花后5天籽粒。1两种实时定量结果分别于高通量测序的结果进行比合高通量分析植物miRNA的表达谱。该研究首次对....

图1-45'RLM-RACE流程图(Wangetal.,2004b)

的，所以利用生物信息学预测植物miRNAs的靶标是相对比较直接究者们已设计了多种预测软件，主要包括TargetFinder（http://jcclate.edu/node），PatScan，miRU（http://bioinfo3.noble.org/miRU.htm....

本文编号：3903881