平邑甜茶两类新生根诱导应用及其生物信息数据库构建

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平邑甜茶两类新生根诱导应用及其生物信息数据库构建

     论文目录

中文摘要第1-15页

Abstract第15-19页

1 前言第19-35页

   ·苹果根系研究进展第19-27页

     ·苹果新生根的定义及分类第19-20页

     ·苹果两类新根的功能第20-21页

     ·根系生态适应性与根构型第21-22页

     ·新根起源与诱导更新第22-23页

     ·根系发生规律及补偿第23-24页

     ·根系寿命与根系效益第24-25页

     ·介质转换与界面效应第25页

     ·苹果砧木根系调控的大田应用第25-26页

     ·苹果根系生长发育分子机理研究进展第26-27页

   ·有机肥与生物炭肥栽培应用研究第27-28页

   ·苹果功能基因组学研究第28-33页

     ·苹果基因组测序及相关信息第28-29页

     ·苹果基因家族研究进展第29-31页

     ·苹果转录组研究进展第31-32页

     ·生物信息学数据库简介第32-33页

   ·本研究目的与意义第33页

   ·研究内容与技术路线第33-35页

2 材料与方法第35-45页

   ·供试材料及试验设计第35-39页

     ·差异介质盆栽试验第35页

     ·层次差异水氮诱导和介质诱导栽培试验第35-36页

     ·局部空间改良大田试验第36-37页

     ·三层节水大田试验第37页

     ·两类新生根基因差异表达谱测序第37页

     ·苹果生物信息数据库平台构建第37-39页

   ·测定指标第39-41页

     ·土壤容重及孔隙度第39页

     ·生物量测定第39页

     ·根系数量统计及扫描第39页

     ·叶绿素含量测定第39-40页

     ·光合速率测定第40页

     ·树脂切片制作第40页

     ·石蜡切片制作第40页

     ·丙二醛（MDA）测定第40页

     ·过氧化物酶（POD）的测定第40页

     ·差异表达谱测序第40页

     ·RNA 提取及 qRT-PCR第40-41页

   ·生物学软件的使用第41-45页

     ·本地化 BLAST 方法第41页

     ·本地化 BLAST2GO第41-42页

     ·本地化 Interpro第42页

     ·perl 程序编辑第42页

     ·基因家族分类标准的建立第42-43页

     ·苹果基因家族分类软件 GF1.0第43-44页

     ·苹果 miRNA 搜集及分析第44页

     ·数据库网络化构建第44-45页

3 结果与分析第45-100页

   ·两类新生根生物学研究第45-48页

     ·平邑甜茶新生根解剖结构第45-46页

     ·两类新生根表型结构差异第46页

     ·根组定义、演化及类型第46-48页

   ·两类新生根对植株生长发育的影响第48-53页

     ·两类新生根对叶片质量的影响第48-49页

     ·两类新生根对枝条质量的影响第49-50页

     ·两类新生根对生物量的影响第50-52页

     ·两类新生根对花芽质量的影响第52页

     ·两类新生根对大田产量的影响第52页

     ·两类新生根对根际微生物环境的影响第52-53页

   ·两类新生根栽培诱导研究第53-63页

     ·介质差异诱导第53-56页

       ·生物炭肥与有机肥改良诱导第53-55页

       ·蛭石与土壤层次差异诱导第55-56页

     ·水氮差异诱导第56-57页

       ·水氮诱导断根再生第56页

       ·介质对水氮效果的影响第56-57页

     ·水氮与介质层次诱导第57-62页

       ·水氮与介质诱导根系特征第57-58页

       ·水氮与介质诱导对生长点分布的影响第58-61页

       ·水氮诱导和介质改良的集中性和有效性第61-62页

     ·大田局部改良诱导对根系影响第62-63页

   ·三层节水大田效果试验第63-70页

     ·三层节水对土壤含水量的影响第63-64页

     ·三层节水对根系生长的影响第64-65页

     ·三层节水对叶片解剖结构的影响第65-66页

     ·三层节水对叶绿素含量的影响第66-67页

     ·三层节水对枝条质量的影响第67页

     ·三层节水对花芽质量的影响第67-68页

     ·三层节水对叶片衰老的影响第68-69页

     ·三层节水对大田产量和品质的影响第69-70页

   ·两类新生根差异基因表达谱研究第70-80页

     ·序列信息分析第70-73页

     ·有效差异基因筛选及分析第73-76页

     ·蛋白结构域及互作网络分析第76-78页

     ·两类根系离子转运基因差异第78-79页

     ·新生根生长素信号代谢网络第79-80页

   ·苹果生物信息数据库平台构建及价值评价第80-100页

     ·苹果生物信息数据库分析平台构建第80-94页

       ·数据来源及处理第82-84页

       ·数据库构架第84-85页

       ·苹果基因家族广泛分类及分析第85-89页

       ·苹果 miRNA 及靶基因预测第89-91页

       ·数据库工具及搜索功能第91-93页

       ·基因注释页面第93-94页

     ·苹果生物信息分析平台价值评价第94-100页

       ·基因家族的同源注释第96-97页

       ·蛋白结构域进化及新结构域模型第97-98页

       ·苹果特殊结构域鉴定第98-99页

       ·苹果芯片分析平台利用第99-100页

4 讨论第100-104页

   ·两类根功能差异与光合同化物分配平衡关系第100页

   ·两类根发生基础与碳源差异第100-101页

   ·局部改良与综合管理的栽培制度第101-102页

   ·苹果生物信息数据库平台的价值评价第102-104页

5 结论第104-105页

论文创新点第105-106页

参考文献第106-123页

附件第123-149页

攻读学位期间已发表和待发表论文第149-151页

致谢第151页

论文编号BS2082989，，这篇论文共151页
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