基于生物信息学数据库分析IER2在肿瘤中高表达及其作用机制

发布时间：2024-04-27 18:12

　　人即刻早期反应基因2(immediate early response 2,IER2)可能参与肿瘤的发生发展,但它在此过程中的作用及表达调控的机制仍不清楚。本研究通过在线数据库GEPIA2与Kaplan-Meier Plotter分析发现:TNF和IER2基因在食管癌组织和宫颈癌组织中高表达。而且IER2基因高表达的食管癌病人的预后显著较差。通过UCSC基因组数据库分析发现,在宫颈癌细胞和淋巴细胞内,TNFα(由TNF基因编码)诱导激活NF-κB结合IER2基因区。qRT-PCR检测证明,在食管癌和宫颈癌等细胞内,TNFα诱导NF-κB在转录水平上调IER2基因的表达。本文据此提出,TNFα诱导NF-κB上调IER2基因的表达可能是其在食管癌和宫颈癌等肿瘤中高表达的调控机制。本研究还通过在线数据库GeneMANIA和String分析发现11个与IER2具有关联性的基因。通过在线数据库Oncomine分析发现了88个基因在食管癌细胞内与IER2基因共表达。其中,包含7个与IER2具有关联性的基因ATF3、DUSP1、EGR1、EGR2、FOSB、JUN、NR4A1。本研究通过Oncomi...

【文章页数】：13 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 细胞培养及处理
    1.3 NF-κB结合IER2的特征分析
    1.4 肿瘤组织细胞中IER2的表达分析
    1.5 肿瘤病人生存周期分析
    1.6 与IER2具有关联性基因的分析
    1.7 荧光定量PCR
    1.8 与IER2共表达的基因及其Gene Ontology(GO)注释
    1.9 CCK8法检测肿瘤细胞生长增殖
    1.10统计学方法
2 结果
    2.1 IER2在肿瘤组织及相应正常组织中的表达
    2.2 IER2基因区内NF-κB的结合特征
    2.3 TNFα诱导NF-κB调控IER2基因表达
    2.4 肿瘤细胞高表达的IER2基因功能注释
3 讨论



本文编号：3965525