人腺病毒7型引起的呼吸道感染疫情病原分子生物学分析
发布时间：2022-02-10 12:21
目的对安庆市某部队一起人腺病毒7型引起的急性呼吸道感染暴发疫情进行病原学鉴定,并对其六邻体（Hexon）基因进行测序分析。方法采取Real-time PCR对采集的13份咽拭子标本进行腺病毒核酸检测,阳性标本接种Hep-2细胞进行病毒分离培养。收集阳性分离培养物,采用RT-PCR扩增Hexon的核苷酸序列进行测序,获得序列在NCBI GenBank数据库进行同源比对,MAGE6.0软件进行进化分析、构建进化树。结果获得10份阳性毒株培养物,Hexon基因序列与我国武汉7型腺病毒疫情株Z9/WH/CHN/2015（GenBank号为KX897164）100%同源,与2012AQHAdv7疫情株和2015AQHAdv7散发株100%同源性。结论该起疫情由人腺病毒7型感染引起,安庆地区流行的腺病毒疫情株基因型别稳定,此次的疫情可能源于本地的流行株。
【文章来源】：安徽预防医学杂志. 2019,25(02)
【文章页数】：4 页
【部分图文】：
图１感染腺病毒７ｄ后Ｈｅｐ－２细胞病变情况（×１００）
拉丝现象，为典型腺病毒ＣＰＥ病变特征，如图１所示。图１感染腺病毒７ｄ后Ｈｅｐ－２细胞病变情况（×１００）Ｆｉｇｕｒｅ１Ｈｅｐ－２ｃｅｌｌｌｅｓｉｏｎｓａｆｔｅｒ７ｄａｙｓｏｆｉｎｆｅｃｔｉｏｎｗｉｔｈａｄｅｎｏｖｉｒｕｓ（×１００）２．２．３六邻体基因ＰＣＲ扩增利用ＡｄＨｅｘＳＦ和ＡｄＨｅｘＳＲ引物对１０份分离成功的阳性标本进行六邻体基因ＰＣＲ扩增，扩增产物进行１％琼脂糖凝胶电泳，在约３０００ｂｐ处出现一条清晰的目的基因条带。见图２。纯化回收ＰＣＲ产物，送至上海生物工程有限公司测序。图２六邻体蛋白全基因ＰＣＲ扩增产物电泳图谱Ｆｉｇｕｒｅ２ＥｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓｍａｐｏｆｐｒｏｄｕｃｔｓａｍｐｌｉｆｉｅｄｂｙＨｅｘｏｎｐｒｏｔｅｉｎｗｈｏｌｅｇｅｎｅＰＣＲ２．２．４同源分析及进化树分析１０份阳性毒株所测出的Ｈｅｘｏｎ基因序列长度均符合预期。将该序列提交ＧｅｎＢａｎｋ进行Ｂｌａｓｔ同源性分析，１０份毒株２８安徽预防医学杂志２０１９年４月２０日第２５卷第２期ＡｎｈｕｉＪＰｒｅｖＭｅｄ，Ａｐｒ．２０，２０１９，Ｖｏｌ２５，Ｎｏ．２
的Ｈｅｘｏｎ基因序列完全相同，且与我国２０１５年武汉株Ｚ９／ＷＨ／ＣＨＮ／２０１５（ＧｅｎＢａｎｋ号为ＫＸ８９７１６４）１００％同源性，提示该疫情的病原株属于人腺病毒７型。为分析方便，选取其中一株２０１８０１ＡＱＨＡｄｖ７为代表株做进化分析，人腺病毒不同血清型六邻体基因系统进化树见图３。注：２０１８０１ＡＱＨＡｄｖ为本次疫情分离株的代表株，２０１２ＡＱＨＡｄｖ７为２０１２年安庆一小学的分离株，２０１５ＡＱＨＡｄｖ７ｓａｎｆａ为２０１５年安庆市ＩＬＩ样本的检出株图３人腺病毒不同血清型六邻体基因系统进化树Ｆｉｇｕｒｅ３ＥｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙｔｒｅｅｏｆｈｕｍａｎａｄｅｎｏｖｉｒｕｓＨｅｘｏｎｇｅｎｅｓｙｓｔｅｍｗｉｔｈｄｉｆｆｅｒｅｎｔｓｅｒｏｔｙｐｅｓ３讨论目前，腺病毒感染暴发疫情世界各地均有报道，患者主要出现发热与上呼吸道感染症状，在众多的血清型中，引起呼吸道疾病的主要为３、７、１４、１、２、５、６血清亚型［５－８］，其中ＨＡｄｖ７常常与重症的呼吸道感染相关［６－９］。ＨＡｄｖ７腺病毒有效的传播需要一定的条件，例如人群密集的医院、军营等的环境，ＨＡｄｖ－７大范围流行需也要相对较低水平的群体免疫力。流行病学调查发现，该起疫情发生前，某武警部队进行高强度的体能训练，过度疲劳，这可能使机体的免疫力下降，导致了此次的聚集性疫情发生的原因之一。人ＨＡｄｖ７可分为２０个基因组型［７－１０］，我国流行株主要为ＨＡｄｖ７ｄ型［８，１１］，与ＨＡｄｖ３，ＨＡｄｖ７ｄ感染的临床症状相比更为严重，病人
【参考文献】：
期刊论文
[1]安庆市呼吸道感染疫情人腺病毒的病原分析[J]. 曹孟婵,刘敏鸿,汪金生,李贤相,徐四清,张其威. 安徽预防医学杂志. 2015(01)
本文编号：3618879
【文章来源】：安徽预防医学杂志. 2019,25(02)
【文章页数】：4 页
【部分图文】：
图１感染腺病毒７ｄ后Ｈｅｐ－２细胞病变情况（×１００）
拉丝现象，为典型腺病毒ＣＰＥ病变特征，如图１所示。图１感染腺病毒７ｄ后Ｈｅｐ－２细胞病变情况（×１００）Ｆｉｇｕｒｅ１Ｈｅｐ－２ｃｅｌｌｌｅｓｉｏｎｓａｆｔｅｒ７ｄａｙｓｏｆｉｎｆｅｃｔｉｏｎｗｉｔｈａｄｅｎｏｖｉｒｕｓ（×１００）２．２．３六邻体基因ＰＣＲ扩增利用ＡｄＨｅｘＳＦ和ＡｄＨｅｘＳＲ引物对１０份分离成功的阳性标本进行六邻体基因ＰＣＲ扩增，扩增产物进行１％琼脂糖凝胶电泳，在约３０００ｂｐ处出现一条清晰的目的基因条带。见图２。纯化回收ＰＣＲ产物，送至上海生物工程有限公司测序。图２六邻体蛋白全基因ＰＣＲ扩增产物电泳图谱Ｆｉｇｕｒｅ２ＥｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓｍａｐｏｆｐｒｏｄｕｃｔｓａｍｐｌｉｆｉｅｄｂｙＨｅｘｏｎｐｒｏｔｅｉｎｗｈｏｌｅｇｅｎｅＰＣＲ２．２．４同源分析及进化树分析１０份阳性毒株所测出的Ｈｅｘｏｎ基因序列长度均符合预期。将该序列提交ＧｅｎＢａｎｋ进行Ｂｌａｓｔ同源性分析，１０份毒株２８安徽预防医学杂志２０１９年４月２０日第２５卷第２期ＡｎｈｕｉＪＰｒｅｖＭｅｄ，Ａｐｒ．２０，２０１９，Ｖｏｌ２５，Ｎｏ．２
的Ｈｅｘｏｎ基因序列完全相同，且与我国２０１５年武汉株Ｚ９／ＷＨ／ＣＨＮ／２０１５（ＧｅｎＢａｎｋ号为ＫＸ８９７１６４）１００％同源性，提示该疫情的病原株属于人腺病毒７型。为分析方便，选取其中一株２０１８０１ＡＱＨＡｄｖ７为代表株做进化分析，人腺病毒不同血清型六邻体基因系统进化树见图３。注：２０１８０１ＡＱＨＡｄｖ为本次疫情分离株的代表株，２０１２ＡＱＨＡｄｖ７为２０１２年安庆一小学的分离株，２０１５ＡＱＨＡｄｖ７ｓａｎｆａ为２０１５年安庆市ＩＬＩ样本的检出株图３人腺病毒不同血清型六邻体基因系统进化树Ｆｉｇｕｒｅ３ＥｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙｔｒｅｅｏｆｈｕｍａｎａｄｅｎｏｖｉｒｕｓＨｅｘｏｎｇｅｎｅｓｙｓｔｅｍｗｉｔｈｄｉｆｆｅｒｅｎｔｓｅｒｏｔｙｐｅｓ３讨论目前，腺病毒感染暴发疫情世界各地均有报道，患者主要出现发热与上呼吸道感染症状，在众多的血清型中，引起呼吸道疾病的主要为３、７、１４、１、２、５、６血清亚型［５－８］，其中ＨＡｄｖ７常常与重症的呼吸道感染相关［６－９］。ＨＡｄｖ７腺病毒有效的传播需要一定的条件，例如人群密集的医院、军营等的环境，ＨＡｄｖ－７大范围流行需也要相对较低水平的群体免疫力。流行病学调查发现，该起疫情发生前，某武警部队进行高强度的体能训练，过度疲劳，这可能使机体的免疫力下降，导致了此次的聚集性疫情发生的原因之一。人ＨＡｄｖ７可分为２０个基因组型［７－１０］，我国流行株主要为ＨＡｄｖ７ｄ型［８，１１］，与ＨＡｄｖ３，ＨＡｄｖ７ｄ感染的临床症状相比更为严重，病人
【参考文献】：
期刊论文
[1]安庆市呼吸道感染疫情人腺病毒的病原分析[J]. 曹孟婵,刘敏鸿,汪金生,李贤相,徐四清,张其威. 安徽预防医学杂志. 2015(01)
本文编号：3618879
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