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通路相关模块研究七氟烷和异丙酚在OPCABG术中心肌保护作用

发布时间:2023-10-06 14:47
  [研究背景]冠状动脉疾病的发病趋势近年逐渐增高。非体外循环冠状动脉旁路移植术(off-pump coronary artery bypass graft,OPCABG)是常用的手术治疗方法,其优势是避免了体外循环导致的全身炎性反应、凝血功能紊乱及多器官功能障碍等并发症。七氟烷和异丙酚是CABG中广泛使用的麻醉药物。研究发现异丙酚和七氟烷均具有一定的心血管保护特性,但二者的保护作用机制不同。在过去的几十年中,许多实验策略(关联研究、全基因组关联扫描、蛋白质组学和全球微阵列基因表达分析)已经被应用到研究。Lucchinetti等对心脏手术麻醉中应用吸入麻醉和静脉麻醉在基因表达水平上进行直接比较。这些结果表明,麻醉诱导构成的基因调节可通过调控心肌能量底物代谢,并可预测行OPCABG的患者术后心脏功能。然而,这些麻醉药在基因水平上的潜在机制尚不清楚。基因共表达网络包含了在不同的生物体中表现出相似表达模式的基因。功能相关的基因经常在组成保守转录模块的生物体内共表达。通过构建一个共同表达网络,可以估计不同条件下的潜在的监管关系。为了定义邻接矩阵,我们使用了一个邻接函数,它将共表达的相似性转化为连接...

【文章页数】:129 页

【学位级别】:博士

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符号说明
第一章 研究背景
    1. 麻醉药物在冠状动脉旁路移植术中的心肌保护作用
        1.1 冠心病
        1.2 非体外循环冠状动脉旁路移植术
        1.3 麻醉药物的心肌保护作用
    2. 基因芯片技术及其在药物作用机制中的应用
        2.1 基因芯片表达谱技术
        2.2 基因芯片技术在药物作用机制中的应用
    3. 生物信息学概况及基因表达谱数据库
        3.1 生物信息学概况
        3.2 基因表达谱数据库
        3.3 KEGG数据库
    4. 基因表达谱通路富集分析
        4.1 差异表达基因的识别
        4.2 差异基因功能富集分析
    5. 基因共表达网络建设
    6. 模块挖掘和拓扑分析
    7. 参考文献
第二章 七氟烷和异丙酚在OPCABG术中通路相关的模块
    1. 前言
    2. 资料和方法
        2.1 数据收集
        2.2 数据预处理
        2.3 差异表达基因的筛选
        2.4 差异表达基因富集分析
        2.5 共表达网络分析与建设
        2.6 通路相关的模块挖掘和拓扑分析
    3. 结果
        3.1 差异表达基因
        3.2 差异表达基因的KEGG通路分析
        3.3 差异表达基因共表达网络构建与拓扑分析
        3.4 通路相关模块的挖掘与拓扑分析
    4. 讨论
        4.1 通路相关模块的讨论
            4.1.1 补体与凝血级联通路相关模块
            4.1.2 细胞因子-细胞因子受体相互作用通路相关模块
            4.1.3 P53信号通路相关模块
            4.1.4 NOD样受体信号通路相关模块
            4.1.5 趋化因子信号通路相关模块
            4.1.6 幽门螺杆菌感染上皮细胞信号通路模块
            4.1.7 MAPK信号通路相关模块
            4.1.8 JAK-STAT信号通路模块
            4.1.9 膀胱癌通路相关模块
        4.2 通路中重要基因的讨论
            4.2.1 表达值较高的基因
            4.2.2 位于多个通路相关模块中的基因
            4.2.3 位于共表达网络中心的基因
    5. 结论
    6. 附图表
    7. 参考文献
第三章 总结与展望
    1. 总结
    2. 创新点
    3. 展望
致谢
攻读博士学位期间已发表或待发表的论文
学位论文评阅及答辩情况表
英文论文Ⅰ
英文论文Ⅱ



本文编号:3851908

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