食源性空肠弯曲菌的分子分型及其遗传多样性分析

发布时间：2024-02-26 00:22

　　为了解在2012～2014年从中国不同城市分离到的食源性空肠弯曲菌的遗传多样性特征,本研究采用多序列位点分型(multilocus sequencing typing, MLST)的方法对分离到的33株食源性空肠弯曲菌进行分子分型。研究中,对33株菌株的管家基因使用7对不同的引物进行PCR扩增,并对扩增的产物使用凝胶电泳鉴定后进行测序。将测序结果同Pub MLST中Campylobacter数据库进行比对,以获得对应菌株ST型,并提交新的ST型数据。利用其MLST数据构建进化树和最小生成树。结果显示33株食源性空肠弯曲菌可以分为27个ST型,其中有14种为新的ST型,可形成11种克隆复合体,优势克隆复合体为CC22和CC45,部分菌株的CC型也曾在临床上发现。共存在91种核苷酸多态性位点,部分等位基因之间存在重组。这表明在2012-2014年间分离得到的菌株具有丰富的遗传多样性,并且有潜在致病风险。

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【部分图文】：

图1空肠弯曲菌等位基因重组分裂分解图

为了解管家基因的重组情况，使用SplitsTreev4.0分别对7个管家基因的序列处理，并利用Splitdecomposition构建重组分解分析图，进行Phi-test计算，其结果如表2和图1所示。从表2中Phi-test可知，基因aspA、tkt和uncA没有发生....

图2MLST分型构建的最小生成树

为进一步了解食源性空肠弯曲菌分离株的种群结构，利用BioNumerics7.6对33株菌的MLST数据构建最小生成树（图2）。从图2a可知，所有的菌株可大致分为5簇：第一簇包含有6株菌，6个ST型，除ST3930不能形成克隆复合体外，其他菌株均为CC45；第二簇包括3株菌，3....

图3MLST序列分型构建进化树

MLST分型是一种较为成熟且稳定的分型方式，被广泛的应用于食源性致病菌的溯源和流行性分析。Weinberger等[18]对2003-2012年间自以色列分离的临床分离株和兽医分离株进行MLST分型，并结合人口统计元数据，调查空肠弯曲菌的分子流行病学特征发现，空肠弯曲菌分离株多样性....

本文编号：3911057