溃疡性结肠炎患者及其健康配偶肠道菌群分析及致病机制的研究

发布时间：2024-01-27 02:22

　　第一部分:溃疡性结肠炎患者及其健康配偶肠道菌群结构及多样性的分析——基于16S rRNA基因测序技术的研究[目 的]利用16S rRNA基因测序技术进行UC患者及其健康配偶肠道菌群结构及多样性分析,揭示UC患者及其健康配偶肠道菌群的差异性。[方 法]收集初发型、轻中度UC患者及其健康配偶各28人的粪便及肠道粘膜,共计56例,其中男性女性各28人,城市农村各28人。提取DNA,PCR扩增后通过Illumina测序仪(25,000tags,MiSeq 平台)进行 16S rRNAV3-V4 区测序。对16S rRNA 测序结果进行生物学信息分析。[结 果]1.聚类OTU与物种注释:112个样品共产生1129个OTU,门水平上,主要由拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)组成,涉及到11个菌属拟杆菌属(Bacteroides)、普雷沃菌属(Prevotella)、埃希氏杆菌属(Escherichia)、粪杆菌属(Faecalibacterium)、罗斯氏菌属(Roseburia)、乳球菌属(Lactococcus)、...

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【学位级别】：博士

图１总体工作流程图??

图８?ＵＣ患者肠道菌群的系统进化树??５?ＵＣ患者及其健康配偶共有独有的菌群分析??将样本分组后的ＯＴＵ物种注释进行比对，发现健康对照组粪便样本（ＦＨ）??

图９?ＯＴＵ维恩图??（ＦＨ，健康对照组粪便样本；?ＦＵ，溃疡性结肠炎组粪便样本；??ＭＨ，健康对照组肠粘膜样本；ＭＵ，溃疡性结肠炎组肠粘膜样本）??

图１０肠道菌群Ａｌｐｈａ多样性不同指数的稀释曲线??（Ｓｈｆ，健康对照组粪便样本；?Ｓｐｆ，溃疡性结肠炎组粪便样本；??

本文编号：3886125