基于DNA甲基化的结直肠癌分子标志物的筛

发布时间：2023-05-13 08:56

　　研究背景和目的结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是常见的消化道恶性肿瘤之一。世界范围内,结直肠癌的发病率和死亡率居常见恶性肿瘤的第三位和第四位。在我国,结直肠癌的发病率和死亡率正不断地增加,已然成为重大公共卫生问题。由于早期诊断对结直肠癌患者预后的判定、治疗方案的选择有着重要的意义。因此,寻找出能够早期发现结直肠癌的肿瘤标志物显得尤为重要。结直肠癌的发生发展是一个涉及多因素、多步骤的复杂过程,除与生活方式、饮食习惯等环境因素相关外,其主要发病机制涉及到一系列遗传学和表观遗传学的积累改变。DNA甲基化是重要的表观遗传调节机制之一,并与结直肠癌的发生发展密切相关。基因启动子区域的异常甲基化导致肿瘤抑癌基因的转录沉默和原癌基因的转录激活,可促进结直肠癌的发生发展。研究DNA甲基化的异常改变可以为发现结直肠癌相关原癌基因或抑癌基因提供新线索,对于阐明结直肠癌发生的分子机制有着重要的意义。同时,亦可为结直肠癌的诊断、治疗和预后等方面提供新思路。因此,为了系统地探索结直肠癌的甲基化分子标志物,本研究首先基于全基因组DNA甲基化和表达谱筛选结直肠癌相关分子标志物,随后对筛选的标志...

【文章页数】：142 页

【学位级别】：博士

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致谢
摘要
ABSTRACT
缩略语
1. 引言
2. 材料与方法
    2.1 研究对象
    2.2 临床资料收集和标本采集
    2.3 实验室检测
    2.4 公共数据库
    2.5 仪器设备
    2.6 主要生物化学制剂
    2.7 所用溶剂配方
    2.8 细胞生物学实验
    2.9 统计分析方法
    2.10 研究策略和技术路线
第一部分 基于全基因组DNA甲基化和表达谱筛选结直肠癌相关分子标志物
    3.1 结果
        3.1.1 研究对象的基本描述
        3.1.2 结直肠癌组织和正常组织中差异DNA甲基化和表达的基因的筛选
        3.1.3 筛选基因在TCGA数据库中的验证
        3.1.4 筛选基因的甲基化水平在122例结直肠癌患者的验证
        3.1.5 甲基化抑制剂对结直肠癌细胞中候选基因表达和甲基化的影响
        3.1.6 基因表达改变对结直肠癌细胞生物学行为影响
    3.2 讨论
第二部分 基于差异DNA甲基化位点的结直肠癌鉴别诊断模型的构建和评估
    4.1 结果
        4.1.1 鉴别诊断模型的特征CpG位点筛选
        4.1.2 结直肠癌患者的甲基化风险指数的计算
        4.1.3 甲基化评分与结直肠癌患者的临床病理参数的关系
        4.1.4 鉴别诊断模型的验证和评估
    4.2 讨论
第三部分 基于差异DNA甲基化位点的结直肠癌预后指数模型的构建和评估
    5.1 结果
        5.1.1 预后相关的CpG位点的筛选
        5.1.2 预后指数的计算
        5.1.3 预后指数的评价
        5.1.4 预后相关CpG位点及预后指数的验证
        5.1.5 联合预测指数的构建及验证
    5.2 讨论
6. 总结与展望
参考文献
附录
文献综述
    参考文献
作者简历及在读期间所取得科研成果



本文编号：3815621