五种斑潜蝇形态特征比较研究及重要种的遗传结构分析

发布时间：2022-10-06 17:01

　　斑潜蝇属Liriomyza种类繁多,约有160种可为害栽培作物和观赏植物。由于这些昆虫个体小或微小（长1.3～2.1mm）,形态特征相似,部分种类生态位重叠明显,种间竞争与替代迅速,鉴定工作受虫态和虫体保存完整状态的限制,因此其分类鉴定比较困难,在实际工作中容易造成混乱,给植物检疫、测报和防治等工作带来困难。2014-2017年作者调查采集了中国大陆11省、38市4771头斑潜蝇属昆虫,经形态和分子鉴定种类共有5种,分别为三叶斑潜蝇L trifolii、美洲斑潜蝇L.sativae、南美斑潜蝇L.huidob、rensis番茄斑潜蝇L.bryoniae和葱斑潜蝇L.chinensis,其中前三种是目前世界上最具为害性的入侵性斑潜蝇。为了进一步研究斑潜蝇属昆虫种间和种内的形态学特征变异和基因遗传分化程度,给检疫鉴定工作提供准确的依据和更便捷的鉴定方法,给斑潜蝇的分化、扩张、控制和防治工作提供理论研究基础,本文对采集到的5种4771头斑潜蝇个体形态特征做了详细的比较分析,其中对5种285头斑潜蝇个体的主要背面特征（详见附录Ⅰ）做了拍照记录和线粒体COI基因检测的验证,以期探索更稳定、快速和... 

【文章页数】：139 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要 ABSTRACT 第一章 文献综述
1 斑潜蝇属的研究概况
    1.1 斑潜蝇属的分类研究简史
    1.2 斑潜蝇属的形态分类
    1.3 五种重要斑潜蝇的形态鉴别特征
    
1.3.1 三叶斑潜蝇
    
1.3.2 美洲斑潜蝇
    
1.3.3 南美斑潜蝇
    
1.3.4 番茄斑潜蝇
    
1.3.5 葱斑潜蝇
    1.4 五种重要斑潜蝇的研究概况
    
1.4.1 三叶斑潜蝇
    
1.4.2 美洲斑潜蝇
    
1.4.3 南美斑潜蝇
    
1.4.4 番茄斑潜蝇
    
1.4.5 葱斑潜蝇
    1.5 五种重要斑潜蝇的分子生物学研究
2 物种分化的方式
    2.1 异域物种分化
    2.2 同域物种分化
    2.3 种群分化研究概述
    2.4 昆虫本身具备的种群分化的条件
    2.5 斑潜蝇的种群分化研究
3 线粒体基因组学研究概况
    3.1 线粒体简介
    3.2 动物线粒体基因组
    3.3 线粒体DNA的进化
    3.4 线粒体RNA二级结构变化
    3.5 斑潜蝇线粒体基因组研究概况
4 微卫星标记研究概况
    4.1 微卫星序列的概念和类型
    4.2 微卫星的功能
    
4.2.1 作为重组和复制密码
    
4.2.2 参与结构基因的表达
    
4.2.3 作为染色质折叠密码
    
4.2.4 与性别决定有关
    
4.2.5 与蛋白表达的剂量效应有关
    
4.2.6 参与组成端粒与着丝粒结构
    4.3 微卫星标记多态性形成的机理
    
4.3.1 滑链错配假说
    
4.3.2 基因重组假说
    4.4 微卫星标记的特点
    
4.4.1 数量丰富
    
4.4.2 丰富的多态性
    
4.4.3 共显性遗传
    
4.4.4 具有一定的通用性
    
4.4.5 检测的高效性
5 小结与讨论 第二章 五种重要斑潜蝇的形态鉴定研究
1 材料与方法
    1.1 供试样本
    1.2 主要试剂
    1.3 主要仪器
    1.4 观察、解剖及拍摄方法
2 结果与分析
    2.1 雄性外生殖器
    2.2 内外项鬃着生区域颜色
    2.3 翅脉M3+4脉比例
    2.4 腹部背面观
3 讨论与小结 第三章 基于线粒体基因COI与核基因EF-1A的种群遗传结构分析
1 材料与方法
    1.1 供试样本
    1.2 主要试剂
    1.3 主要仪器
    1.4 基因组DNA的提取
    1.5 引物设计和PCR反应
    1.6 PCR产物检测及测序
    1.7 序列整理及数据分析
2 结果与分析
    2.1 基因片段的序列分析
    
2.1.1 三叶斑潜蝇种群COI基因片段的序列分析
    
2.1.2 三叶斑潜蝇种群EF-1a基因片段的序列分析
    2.2 五种斑潜蝇遗传多样性的分析
    
2.2.1五种斑潜蝇COI基因各种群内的遗传多样性分析
    
2.2.2 五种斑潜蝇EF-1a基因各种群内的遗传多样性分析
    2.3 三叶斑潜蝇种群间遗传多样性的分析
    
2.3.1 三叶斑潜蝇种群间遗传分化
    
2.3.2 分子变异分析
    2.4 5种斑潜蝇单倍型系统发育
    
2.4.1 5种斑潜蝇系统发育树
    
2.4.2 三叶斑潜蝇种群系统发育树
    2.5 单倍型网络图
    
2.5.1 三叶斑潜蝇单倍型的网状图
3 小结与讨论 第四章 基于微卫星标记的三叶斑潜蝇及近似种种群遗传结构对比分析
1 材料与方法
    1.1 供试样本
    1.2 主要试剂及主要仪器
    1.3 基因组DNA的提取
    1.4 微卫星序列的检测与引物设计
    1.5 微卫星标记的多态性检测
    1.6 微卫星位点扩增
    1.7 基因分型
    1.8 数据分析
2 结果与分析
    2.1 基因组DNA提取结果
    2.2 引物筛选结果
    2.3 微卫星位点多态性检测结果
    2.4 种群的遗传多样性
    
2.4.1 位点间的遗传多样性
    
2.4.2 种群间的遗传多样性
    
2.4.3 种群间的遗传分化
    2.5 种群遗传结构
    2.6 瓶颈效应的检测
3 小结与讨论 第五章 葱斑潜蝇线粒体基因组
1 材料和方法
    1.1 样品和DNA提取
    1.2 PCR扩增和测序反应
    1.3 测序组装、注释和分析
    1.4 系统进化分析
2 结果与分析
    2.1 核苷酸组成
    2.2 蛋白质编码基因
    2.3 转运tRNA基因
    2.4 核糖体rRNA基因
    2.5 控制区(A+T富含区)
    2.6 系统进化分析
3 小结与讨论 参考文献 附录 致谢 攻读学位期间发表的学术论文目录


【参考文献】：
期刊论文
[1]三叶斑潜蝇幼虫种群空间格局及抽样技术研究[J]. 常亚文,何娅婷,沈媛,龚伟荣,田子华,杜予州.  环境昆虫学报. 2016(04)
[2]江苏地区三叶斑潜蝇和美洲斑潜蝇的发生危害及种群动态[J]. 常亚文,沈媛,董长生,龚伟荣,田子华,杜予州.  应用昆虫学报. 2016(04)
[3]半翅目昆虫线粒体基因组学研究进展[J]. 郭仲龙,袁明龙.  中国科学:生命科学. 2016(02)
[4]江苏地区三叶斑潜蝇发生规律与综合防控技术[J]. 龚伟荣,褚姝频,胡婕,杜予州.  江苏农业科学. 2013(10)
[5]双翅目昆虫线粒体基因组结构特点及其测序通用引物的设计和应用[J]. 张乃心,张玉娟,余果,陈斌.  昆虫学报. 2013(04)
[6]江苏省三叶斑潜蝇发生调查及分子检测[J]. 杨飞,曹婧曼,杜予州.  植物保护. 2010(06)
[7]美洲斑潜蝇不同寄主种群及地理种群间的β-tubulin基因序列分析[J]. 杜予州,王莉萍,陆亚娟,郑福山,陆自强.  中国农业科学. 2008(05)
[8]三叶斑潜蝇在中国的适生区预测[J]. 雷仲仁,姚君明,朱灿健,王海鸿.  植物保护. 2007(05)
[9]不同地理种群美洲斑潜蝇及近缘种的rDNA-ITS1序列分析和比较[J]. 王莉萍,杜予州,何娅婷,陆亚娟,陆自强.  昆虫学报. 2007(06)
[10]中国斑潜蝇属种类和2新纪录种记述（双翅目,潜蝇科）[J]. 陈文龙,李子忠,顾丁,柳琼友.  西南大学学报(自然科学版). 2007(04)

博士论文
[1]几种入侵斑潜蝇线粒体全基因组序列分析及种群分化研究[D]. 王帅宇.中国农业科学院 2010

硕士论文
[1]水稻大螟种群遗传结构研究[D]. 汤小天.扬州大学 2016
[2]江苏地区番茄斑潜蝇的生物学及生态学研究[D]. 何娅婷.扬州大学 2008
[3]美洲斑潜蝇的种群分化研究[D]. 陆亚娟.扬州大学 2003



本文编号：3687028