circPARP4在肺腺癌中的表达及在肺腺癌发生发展中的作用

发布时间：2024-03-23 15:38

　　目的:研究circPARP4的表达与肺腺癌的关系,并探讨circPARP4在肺腺癌发生发展中的作用。方法:(1)对支气管上皮细胞(BEAS-2B)、肺腺癌细胞(H1299)培养,分别取3个BEAS-2B和H1299细胞样本行RNA Seq测序,获取全部circRNAs序列,对序列进行分析,获取差异circRNAs表达谱。(2)将差异circRNAs表达谱的测序结果比对到circBase数据库中,选取在H1299细胞中显著下调的circRNA为目标circRNA。使用UCSC数据库进一步分析目标circRNA分子来源与结构。(3)采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测20例肺腺癌患者手术标本,比较每份标本癌组织和癌旁组织目标circRNA的表达差异;分析目标circRNA的表达水平与临床病理参数的关系。(4)使用RBPDB数据库对目标circRNA结合的蛋白质(RNA bingding protein,RBP)进行预测,利用TCGA数据库分析目标RBP在肺腺癌样本中总体表达情况及与患者预后的相关性。对目标circRNA下游靶基因行GO和KEGG pathway分析,推测目标ci...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1：H1299细胞circRNAs表达的聚类分析

16结果1.H1299细胞circRNAs的差异表达谱相比较于BEAS-2B细胞，H1299细胞中共有460个表达差异的circRNAs，278个circRNAs显著表达差异上调，182个circRNAs显著表达差异下调。通过聚类分析可以看出BEAS-2B细胞和H1299细胞ci....

图2：H1299细胞circRNAs表达的散点图

17图2：H1299细胞circRNAs表达的散点图图3：H1299细胞circRNAs表达的火山图图4：差异表达circRNAs的染色体分布特征图5：差异表达circRNA类型分布特征注：图1绿色代表circRNA在H1299细胞中表达相对下调；红色代表circRNA在H129....

图3：H1299细胞circRNAs表达的火山图

17图2：H1299细胞circRNAs表达的散点图图3：H1299细胞circRNAs表达的火山图图4：差异表达circRNAs的染色体分布特征图5：差异表达circRNA类型分布特征注：图1绿色代表circRNA在H1299细胞中表达相对下调；红色代表circRNA在H129....

图4：差异表达circRNAs的染色体分布特征

17图2：H1299细胞circRNAs表达的散点图图3：H1299细胞circRNAs表达的火山图图4：差异表达circRNAs的染色体分布特征图5：差异表达circRNA类型分布特征注：图1绿色代表circRNA在H1299细胞中表达相对下调；红色代表circRNA在H129....

本文编号：3936126