短花针茅荒漠草原单条土壤线虫分子鉴定方法研究

发布时间：2023-10-02 06:47

　　土壤线虫在土壤中具有重要的生态作用,目前大多通过形态学鉴定方法研究土壤线虫,但该方法有很多弊端。为了更好地在分子水平上研究土壤线虫群落及其多样性,对内蒙古短花针茅荒漠草原土壤线虫进行了单条线虫的分子鉴定,通过比较4种不同的DNA提取方法(试剂盒法、冻融法、切割法、切割冻融法),确定了土壤线虫最佳的DNA提取方法为切割冻融法。同时,选出10对土壤线虫的通用引物经过重复试验,从10对引物中筛选出3对引物(分别为线虫rDNA的18S区引物G18SU/R18Tyl1、28S区引物D2A/D3B、ITS区引物TW81/AB28)能达到较高的成功率,其中适用于内蒙古短花针茅荒漠草原土壤线虫的最佳通用引物是:D2A/D3B(5‘-ACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTG-3’;5‘-TGCGAAGGAACCAGCTACTA-3’)。本研究通过明确短花针茅荒漠草原土壤线虫最佳DNA提取方法和最佳通用引物,为进一步通过高通量测序技术在分子水平上进行土壤线虫研究奠定基础。

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【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 研究区概况
    1.2 土壤样品采集和线虫形态学鉴定
    1.3 土壤线虫的分子鉴定方法
        1.3.1 DNA提取方法
        1.3.2 引物筛选
2 结果与分析
    2.1 短花针茅荒漠草原土壤线虫DNA提取的最佳方法
    2.2 短花针茅荒漠草原土壤线虫rDNA的18S区、28S区、ITS区最佳引物筛选
    2.3 测序结果与分析
3 结论与讨论



本文编号：3850311