莱茵衣藻响应缺硫的环状RNA的预测与鉴定

发布时间：2024-01-25 09:25

　　环状核糖核酸(circular ribonucleic acid,circular RNA或circRNA)是一类无5’帽子结构及3’poly A尾,以共价键连接形成闭合环形结构的非编码RNA分子,通过转录后调控的方式参与动植物细胞的众多代谢途径.莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii,C. reinhardtii)是一种重要的真核单细胞模式微藻,为探究其是否存在环状RNA,本研究通过RNA-Seq高通量测序分析正常与缺硫培养的C. reinhardtii RNA组学数据,首次预测获得218条环状RNA序列,通过对比缺硫处理前后莱茵衣藻环状RNA序列,获得8条差异表达的环状RNA序列(其中,5条为表达上调、3条为表达下调).本研究首次对单细胞真核微藻莱茵衣藻进行环状RNA的生物信息学预测,确认莱茵衣藻环状RNA响应缺硫胁迫,为下一步揭示莱茵衣藻环状RNA参与响应莱茵衣藻缺硫的作用机制奠定基础.

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图1缺硫前后莱茵衣藻中环状RNA表达量密度分布

图2莱茵衣藻缺硫前后环状RNA的表达差异

本文编号：3884558