蕨类植物质子焦磷酸酶编码基因的鉴定及进化分析

发布时间：2023-10-15 15:02

　　为了全面鉴定蕨类植物中质子焦磷酸酶(AVP1)编码基因,并构建家族进化关系,本研究首先通过检索PfamA数据库从AVP1蛋白序列中鉴定到了一个保守结构域,在此基础上,结合HMMER和BLAST,从6个物种基因组中鉴定到了18条质子焦磷酸酶家族基因。进化树构建结果表明,在勺叶槐叶萍中没有鉴定到AVP亚家族成员;而在细叶满江红中没有鉴定到AVPL亚家族成员。本研究为今后针对蕨类植物中AVP1基因功能的深入研究提供了基因靶标。

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【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 保守结构域鉴定
    1.2 含PF03030.15结构域的序列挖掘
    1.3 质子焦磷酸酶基因(AVP1)基因家族进化树构建
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 基因模型数据库下载及修正
    3.2 保守结构域鉴定
    3.3 含有特定结构域的序列挖掘
    3.4 进化树构建
作者贡献



本文编号：3854131