黄瓜CsMYB108基因的克隆与序列分析

发布时间：2024-03-22 00:59

　　中国黄瓜品种繁多,目前黄瓜杂种优势是选育新品种的关键,杂种优势是一种植物共有的独特生物现象,然而黄瓜杂种优势的分子机理研究还尚未深入。为探究黄瓜杂种优势形成的机理,本研究中父本D0708-2田间表现为雌雄同株,早熟性佳,但是抗病抗逆性差,母本D1104-2-4田间表现为强雌性系,抗病抗逆性佳。以超亲优势的杂交种C15-114为试验材料,筛选出一个与父母本的差异基因Cs MYB108,并运用基因克隆技术克隆了该基因并对该蛋白进行生物信息学分析,挖掘该基因在黄瓜遭遇逆境胁迫过程中所参与的作用机制。结果表明:CsMYB108转录因子全长675 bp,编码225个氨基酸,该转录因子编码的蛋白质属于细胞核中的疏水性蛋白质,并无明显信号肽和无跨膜结构。与甜瓜构成同一进化分支,同源性较高。本研究结果为黄瓜的杂种优势提供理论依据,也为进一步试验研究提供基因材料。

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【部分图文】：

图2CsMYB108在不同黄瓜品系中表达

图1总RNA电泳检测1.3CsMYB108的基因克隆与酶切验证

图3CsMYB108PCR扩增产物(A)与酶切验证(B)

通过PCR技术，以黄瓜D0708-2、D1104-2-4和C15-114黄瓜品系茎尖cDNA为模板，CsMYB108上游和下游引物扩增序列全长，1%琼脂糖凝胶电泳扩增出1条长度超过600bp的目的片段(图3A)，将该片段切下回收后，将其连接到pSXCN-1250载体上，利用质粒....

图4CsMYB108的保守结构域

通过SOPMA软件分析CsMYB108蛋白的二级结构，结果发现在整个多肽链中，占比最多的是α螺旋，有110个，占比为49.11%；其次是无规则卷曲，有97个，占比为43.40%；然后是β折叠，有11个，占比是4.91%；最后是延伸主链，有6条，占比是2.68%(图7)。另外，把C....

图1总RNA电泳检测

基于本实验室前期的转录组数据中，MYB家族中的CsMYB108在杂交组合中的DEGs数值显著大于父本，与母本接近。因此，本研究中通过qRT-PCR技术的验证测序结果。qRT-PCR结果表明，CsMYB-108在D1104-2-4中表达量为D0708-2的6.86倍，C15-114....

本文编号：3934394