森林草莓中组蛋白甲基化修饰酶基因的鉴定与分析

发布时间：2023-05-26 23:34

　　组蛋白修饰在动植物生长发育过程中有着重要作用。而组蛋白甲基化作为一种重要的组蛋白修饰,对于植物的生长发育至关重要。组蛋白甲基化修饰由组蛋白甲基化酶和去甲基化酶所调控。目前在植物中已经发现了包含SET结构域的组蛋白甲基化酶,根据SET结构域序列的保守性可以将其分为7类,而且每一类都具有其特定的结构和功能。同时,在植物中已发现的的去甲基化酶有JmjC和LSD两大类。二倍体森林草莓全基因组序列的测定,为基因组水平上研究与草莓性状相关基因奠定了坚实的基础。目前,植物中组蛋白甲基化酶和去甲基化酶相关基因在拟南芥中的研究已相对完善,这对于研究草莓中组蛋白甲基化修饰酶相关基因提供了重要依据。草莓是一种营养丰富且极具经济价值的园艺作物,对组蛋白甲基化在草莓果实生长发育中的研究,将会为草莓新品种培育提供重要的参考依据。本研究以生物信息学和分子生物学相结合的方式,搜索并鉴定出草莓中组蛋白甲基化修饰酶相关基因,并以拟南芥、葡萄、中国莲、玉米、水稻、无油樟、卷柏七个个物种为对照,系统地研究了这些基因在草莓中的进化历程。同时,我们还研究了这些基因在森林草莓果实不同发育阶段的表达模式以及逆境条件下的表达水平的变化...

【文章页数】：86 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
    1 草莓起源和种类
    2 组蛋白甲基化的研究进展
        2.1 组蛋白甲基化
        2.2 组蛋白甲基化酶的分类、结构和功能
    3 组蛋白去甲基化研究进展
        3.1 组蛋白去甲基化
        3.2 组蛋白去甲基化酶及其功能
    4 组蛋白甲基化对基因表达的调控
    5 组蛋白甲基化酶在植物生长发育过程中的作用
    6 组蛋白去甲基化酶在植物生长发育过程中的作用
    7 研究的目的和意义
    参考文献
第二章 组蛋白甲基化酶基因的生物信息学分析
    1 材料和方法
        1.1 物种选择和数据来源
        1.2 组蛋白赖氨酸甲基化酶基因的鉴定
        1.3 多序列比对和系统进化树构建
        1.4 组蛋白甲基化酶结构域鉴定和Motif分析
        1.5 组蛋白甲基化酶基因染色体定位和扩张分析
    2 结果与分析
        2.1 森林草莓中组蛋白甲基化酶基因的鉴定
        2.2 森林草莓中SET基因的进化和扩张
    3 讨论
    参考文献
第三章 组蛋白去甲基化酶基因的生物信息学分析
    1 材料和方法
        1.1 组蛋白去甲基化酶基因的鉴定
        1.2 多序列比对和系统进化树构建
        1.3 组蛋白去甲基化酶结构域组成分析
    2 结果与分析
        2.1 森林草莓中组蛋白去甲基化酶基因的鉴定
        2.2 森林草莓中组蛋白去甲基化酶基因的进化分析
    3 讨论
    参考文献
第四章 组蛋白甲基化酶和去甲基化酶基因的表达分析
    1 材料和方法
        1.1 植物材料
        1.2 冷胁迫和热胁迫处理
        1.3 草莓组织RNA的提取
        1.4 RNA电泳分析
        1.5 RNA纯度检验
        1.6 实时荧光定量PCR
        1.7 组蛋白甲基修饰酶基因表达数据来源和数据处理
    2 结果与分析
        2.1 森林草莓花和果实发育中组蛋白甲基化酶和去甲基化酶基因的表达模式
        2.2 森林草莓SET基因在冷胁迫和热胁迫下的表达模式
    3 讨论
    参考文献
全文讨论
    参考文献
全文结论
创新点
附录
攻读硕士期间的论文发表情况
致谢



本文编号：3823478