中国白栎组单拷贝核基因标记的开发及系统发育关系研究

发布时间：2023-05-27 01:53

　　物种之间的系统发育关系及物种形成过程一直以来都是进化生物家研究的焦点。系统发育关系重建可以清楚地显示物种之间的系统发育关系,而物种形成过程的研究能够从本质上解释物种进化的进程。随着测序技术的发展,计算机科学及生物信息学软件的开发给系统发育分析及物种形成过程的研究注入了新的活力。栎属物种存在广泛的种间杂交,引起了植物分类学家们的注意。然而,关于栎属物种的界定和种间系统发育的相关研究非常有限。本文中,依据蒙古栎(Quercus mongolica)和欧洲夏栎(Q.robur)的转录组序列,开发了19对在白栎组(section Quercus)中直系同源的单拷贝核基因序列。使用5个叶绿体位点,探讨叶绿体DNA变异在中国分布的白栎组物种中的共享情况,从而进一步探讨叶绿体序列变异在白栎组物种界定研究中的局限性。最后,利用19个单拷贝核基因序列的数据对在中国和日本分布的白栎组进行了物种界定,以及中国白栎组的系统发育关系研究。主要研究结果如下:1)根据蒙古栎和夏栎的转录组序列开发了19个位点单拷贝基因序列标记,通过所开发的引物扩增栎属白栎组、土耳其栎组和红栎组部分物种的DNA样品,发现这些标记可在栎...

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【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
第一章 绪论
    1.1 引言
        1.1.1 研究背景
        1.1.2 国内外研究现状及评述
    1.2 研究目标和主要研究内容
        1.2.1 关键的科学问题与研究目标
        1.2.2 主要研究内容
第二章 白栎组单拷贝核基因标记的开发及其在物种形成中分析中的应用
    2.1 材料与方法
        2.1.1 试验材料
        2.1.2 引物设计
        2.1.3 引物筛选
        2.1.4 PCR扩增及测序
        2.1.5 序列比对和核苷酸多样性
        2.1.6 系统发育关系的重建
        2.1.7 贝叶斯聚类分析及对比
        2.1.8 蒙古栎和辽东栎的分化
    2.2 结果与分析
        2.2.1 试验结果
        2.2.2 试验分析
    2.3 小结
第三章 白栎组叶绿体变异研究
    3.1 材料与方法
        3.1.1 试验材料
        3.1.2 分子标记实验
        3.1.3 序列数据分析
    3.2 结果与分析
        3.2.1 试验结果
        3.2.2 试验分析
    3.3 小结
第四章 白栎组分子系统发育学的研究
    4.1 材料与方法
        4.1.1 试验材料
        4.1.2 PCR扩增及测序
        4.1.3 数据分析
    4.2 结果与分析
        4.2.1 试验结果
        4.2.2 试验分析
    4.3 小结
第五章 结论
    5.1 结论
    5.2 展望
参考文献
在读期间的学术研究
致谢??



本文编号：3823669